サービスについて

価格と納期

サービスは次の2プランをご用意しております。※1

■サンガーシーケンスプラン

価格8検体あたり:12万円(1サンプルあたりの参考価格:15,000円)
納期5-10営業日
利用例ウイルスゲノム、融合遺伝子のクロナリティ解析 など…

■次世代シーケンス(NGS)プラン

価格8検体あたり25万円(1サンプルあたりの参考価格:31,250円)
納期20営業日
オプションリファレンスマッピングによる挿入位置の決定(+20,000円/ターゲット)
利用例ゲノム編集やウイルスベクターによるノックインのオフターゲット検出、など…

ご依頼の流れ

①サンプル準備 ※2
精製済みのゲノムD N Aを1サンプルあたり200 ng /μl以上、10 μl以上を目安にお送りください。ゲノムの品質が解析結果に影響することがございますので、クオリティチェックを実施いただきますようお願いいたします。※必ずRNase処理をしていただきますようお願いいたします。
②サンプル送付
専用のオーダーシートをH Pよりダウンロードしていただきます。必要事項をご記入いただき、dnacraft@fasmac.co.jpまで送付をお願いします。
またオーダーシートの印刷物ならびに電気泳動写真をサンプルに同梱の上、以下の宛先まで冷蔵便でお送りください。
〒243-0021
神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービルA棟4階
株式会社ファスマック ランダムインテグレ―ション解析担当 宛
TEL 046-281-9909
※オーダーシートのダウンロードはこちらから
なお、初めてご依頼されるお客様は、あらかじめ以下のサイトからユーザー登録をお願いします。
③解析受注
サンプルを受領いたしましたら、解析受注のご報告メールをお送りいたします。
④サンプルのクオリティチェック
蛍光定量装置にて濃度測定を行います。明らかに基準に満たない場合には、お客様へ連絡し、以降の作業について進めるかどうかご連絡差し上げます。
⑤プライマー設計 ※3
ご連絡いただいた外来DNAの配列情報からin silicoにてプライマーを設計いたします。
⑥サンプル調製
RAIS法にてサンプル調製を行います。蛍光定量装置にて濃度測定を行い、キャピラリー電気泳動でサイズ確認を行います。不良の場合には再度サンプル調製からやり直し、それでも不良の場合にはご相談の上、解析を中止とさせていただきます。この場合、料金はサンプル調製までの費用をいただきます(50,000円)。
⑦シーケンス ※4
ご選択いただいたプランに基づき、シーケンスを実施いたします。
⑧データ納品 ※5
データは生データでご提供いたします。サンガーシーケンスプランの場合はメール、NGSプランの場合にはUSBメモリにて納品いたします。
納品物
サンガーシーケンスプラン:波形データ(ab1ファイル)、配列データ(txtファイル)
NGSプラン:品質値付きのMiseq出力配列(fastqファイル)
※1 本サービスでは一度の解析で複数の挿入部位を検出することが可能ですが、存在する挿入部位全ての検出を保証するものではありません。また、解析結果には偽陽性が含まれる可能性もあります。必要に応じて別途確認実験を行ってください。
※2 以下の方法を参考にクオリティチェックをお願いします。
・吸光度計により、A260/A280≧1.6 、A260/A230 ≧1.6であることを確認
・アガロース電気泳動により、分解がないことを確認。
右図のゲル画像を例にした場合、Aはクオリティに問題なく、Bは分解が見られておりクオリティに問題があると判断。
※3 ご連絡いただく外来DNAの配列中に予期せぬ変異が入っていた場合、解析結果が得られない場合が有ります。
※4 解読長はそれぞれ以下の通りです(参考)
・サンガーシーケンスプラン:600-700bp
・NGSプラン:300bp
※5 解析オプションを選択した場合には、外来DNAの挿入位置情報を示したファイルを併せてお送りいたします。