DNAシーケンス解析 高次構造シーケンス解析

shRNA等のヘアピン配列や高次構造配列、GC rich等の難読配列解読

プラスミドテンプレートとシーケンスプライマーを別々のチューブでお送りください。
お送りいただいたプラスミドテンプレートを独自技術にて弊社で調整し、その後シーケンス反応を行うことで、高次構造領域が解読可能です。
強固なヘアピン配列など、通常のシーケンス条件では解読できない難読配列も、高確率で改善が可能です。
なお、こちらのサービスの対象はプラスミドDNAのみとなりまして、PCR産物はお受けすることができません。予めご了承いただきますようお願いいたします。
【価格】 ¥5,000/サンプル
【納期】 サンプル到着後、4営業日
【解読保証bp数】 700-800bp(2hr)
【送付頂くもの】 プラスミドDNA・シーケンスprimer
※サンプル到着日を0日とし、土日・祝日は営業日に含まれませんのであらかじめご了承ください

波形例

AAV-ITR領域(M13R primer) 通常シーケンス
波形例 AAV-ITR領域(M13R primer) 通常シーケンス/AAV-ITR領域(M13R primer) 高次構造シーケンス
AAV-ITR領域(M13R primer) 高次構造シーケンス
波形例 AAV-ITR領域(M13R primer) 通常シーケンス/AAV-ITR領域(M13R primer) 高次構造シーケンス

テンプレートDNAについて

受託可能なサンプルは、プラスミドのみとなります(PCR産物はお受けすることができません)。
市販のプラスミド精製キットにて精製し、電気泳動により純度・濃度チェックを行ってください。
濃度は約100ng/µlにご調製いただき、1.5mlチューブにて10µl程度お送りください。
ニックが多く入った古いプラスミドや、他のテンプレートやDNA断片がコンタミしたプラスミドの場合、その他要因で良好な結果が得られない可能性がございます。
また連続配列後の波形の重なりにつきましては、改善ができませんので、予めご了承下さい。

プライマーについて

シーケンスには、ユニバーサルプライマーやベクター骨格に設計されたプライマーをご利用ください。
サンプルとは別の1.5mlチューブにて、濃度10µMで10µl程度お送りください。
ユニバーサルプライマーのご用意もございます。下記PDFをご参照ください。

ご依頼方法ならびに価格について

ご依頼の際は、webサイト上で「ワンパス解析」をご選択いただき、下段の「その他ご要望事項※ 」にて、
「高次構造シーケンス」とご記入ください。
本解析につきましては、専用の解析種別ではなく「ワンパス解析」のオプション解析として現在承っています。
 
※解析オプション料金(+¥2,000)+ワンパス解析料金(¥3,000) = ¥5,000/解析となります
(金額例)
ワンパス解析ご依頼合計4サンプル(そのうち2つが、+高次構造シーケンスオプションの場合)
ワンパス解析・・・・・・・・・・¥3,000/解析×4サンプル=¥12,000
高次構造シーケンスオプション・・¥2,000×2サンプル=¥4,000

合計:¥16,000(税別)