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RNA TRANSCRIPTOME SEQUENCING

RNA-seq解析パッケージ 発現量算出を含む、トランスクリプトーム解析

RNA-seqはNGSを利用してmRNAを解析し、細胞内で発現する全転写物を網羅的に定量する手法です。 Total RNAからcDNAライブラリを作製してシーケンスを行い、リファレンス配列へマッピングすることで発現量を算出します。 発現比較解析をはじめとした追加解析も取り揃えています。

  • 発現量算出込み
  • DNBSEQ-G400
  • ペアエンドリード
  • 追加解析に対応

PACKAGE & PRICE

価格・納期

発現量算出までを基本パッケージに含め、追加解析は目的に応じて選択いただけます。

基本パッケージ

RNA-seq解析パッケージ

価格
35,000円～／サンプル

日 納期 20営業日～

基本パッケージに含まれる内容

  • Total RNAからのcDNAライブラリ調製
  • MGI社DNBSEQ-G400によるペアエンドシーケンス (6 Gb取得)
  • リファレンス配列へのマッピング
  • TPMなどによる正規化および発現量データの提供
RNA-seq解析の見積を依頼する サンプル条件や追加解析についても、お見積時にご相談いただけます。

WORKFLOW

解析概要

サンプル情報のご提供からライブラリ調製、シーケンス、発現量データの納品までの標準的な流れです。

  1. お客様

    サンプル情報のご提供

    解析に必要なサンプル情報をご提供ください。

  2. お客様

    サンプルの送付

    Total RNAとサンプル情報を弊社へ送付ください。（※1）

  3. 弊社

    ライブラリ調製

    RNAの品質確認後（※2）、ライブラリを作製します。

    作製したライブラリの濃度と品質を確認します。
  4. 弊社

    シーケンス解析

    MGI社DNBSEQ-G400を使用してシーケンシング解析を行い、ペアエンドリードを取得します。

  5. 弊社

    データ解析・納品

    マッピングソフトウェアを用いてリファレンス配列にマッピングします。その後、TPMなどによる正規化を行ったデータを提供します。

OPTION SERVICES

オプションサービスと価格

基本パッケージに加えて、以下のオプションをご指定いただけます。

サンプル調製

作業内容 概要 価格
リボソームRNA除去 polyA-tailを持たないバクテリアのmRNAなど、oligodTで単離できない場合に有効です。 ＋30,000円
／サンプル

データ解析

作業内容 価格
発現比較解析 / 式（※3） ＋20,000円
主成分解析 / 図 ＋10,000円
ヒートマップ作成 ＋10,000円 / 図
De novo transcriptome assembly
（参照ゲノム配列なしの場合）		 ＋100,000円 / 式

HOW TO ORDER

ご依頼方法

お見積のご依頼からサンプル到着まで、以下の流れで承ります。

  1. 見積フォームを送信 必要事項をご記入のうえ、RNA-seq解析 見積依頼フォームよりご送信ください。
  2. お見積書を確認 弊社より提出するお見積書の内容をご確認ください。
  3. サンプルを発送 ご依頼いただける場合は、冷凍便・平日着・着払いにて下記住所へお送りください。
  4. 受注完了 サンプルの到着をもって受注完了とさせていただきます。

NOTES

注意事項

※1

RNAの分解が進んでおり、シーケンシング解析を行ってもデータが得られないと判断した場合は、中止させていただきます。

※2

サンプル推奨条件は以下の通りです。

① 吸光度計によりサンプルの純度をご確認ください。A260/A280 ≧ 1.8、A260/A230 ≧ 2

② 電気泳動にて分解が認められないことをご確認ください（Bioanalyzerをお持ちの場合、RINが8.0以上）。

※3

発現比較解析にはCLCなどのツールを利用します。

DNAシーケンス解析

次世代シーケンス解析

フラグメント解析