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イルミナ―シーケンサーによるカスタム解析

イルミナ社の次世代シーケンサーを用いたオーダーメイドな解析

イルミナ社のMiseq、Nextseqを用いてお客様の実験プランに応じて解析内容を選んでいただくサービスです。 検体数によってはパッケージサービスよりもお得にご利用いただけます。なお、納期は解析内容により変動します。 通常はサンプル到着後1~2ヶ月程度ですが、実際の納期は御見積書をご確認ください。 
ご要望であれば、Teams、Zoomなどオンライン会議ツールでのご相談も可能ですので、お気軽にお問い合わせください。

サンプル調製

(1)　ゲノム用アダプターライブラリ調製

価格 ： 15,000円/サンプル
長鎖PCR産物からゲノムDNAまで幅広くご利用いただけるサンプル調製方法です。 ご依頼サンプルに応じて最適な方法を用いてサンプル調製を行います。サンプルによってはDNA抽出もお引き受け可能ですのでご希望の場合にはあわせてご連絡ください。

(2)　アンプリコン解析用のサンプル調製

作業内容 サンプル数 ご提供サンプル 価格
DNA抽出から 8サンプルまで 検体 40,000円
9～16サンプル 60,000円
PCRから 8サンプルまで 抽出DNA 20,000円
9～16サンプル 30,000円

(3)　RNA-seq用のサンプル調製

作業内容 価格
RNA抽出* 15,000円／サンプル
リボソーム除去(illumina) 30,000円／サンプル
ライブラリ調製(illumina) 25,000円／サンプル
＊弊社でノウハウのないものについてはお断りさせていただく場合があります。

illuminaシーケンサーによるラン

(1)　Miseqでのラン

項目 価格
QC(quality control)作業
送付サンプルの濃度・品質 
チェック[必須]
 16サンプルまで30,000円
共有解析 2×250 bp
他のお客様のサンプルと相乗りで
ランを実施（※1）
 115,000円
共有解析 2×300 bp 150,000円
専有解析 2×250 bp
一人のお客様のサンプルのみで
ランを実施
 330,000円
専有解析 2×300 bp 450,000円

(2)　NextSeq(※2)でのラン

項目 価格
QC(quality control)作業
送付サンプルの濃度・品質 
チェック[必須]
 16サンプルまで30,000円
共有解析 2×75 bp
他のお客様のサンプルと相乗りで
ランを実施（※1）
 100,000円
共有解析 2×150 bp 170,000円
専有解析 2×75 bp
一人のお客様のサンプルのみで
ランを実施
 270,000円
専有解析 2×150 bp 450,000円
※1. 
サンプル投入量10 % 以上を保証いたします。
ただし、データサイズやリード数の保証は行っておりません。 詳細は以下の「解析の結果得られるデータ量について」をご参照ください。
※2. 
中出力キットの価格となります。
高出力キットでの解析をご希望の方は別途ご相談下さい。
 

＜解析の結果得られるデータ量について＞

イルミナ社のカタログスペック値では1ランで得られるデータ量は以下の通りとなっております(ペアエンドリード)
  • 2×250 bp試薬での解析　　7.5~8.5 Gb（2,400万~3,000万リード）
  • 2×300 bp試薬での解析　　13.2~15 Gb（4,400万~5,000万リード）
  • 2×75 bp(Mid)試薬での解析　　16.25～19.5 Gb
  • 2×150 bp(Mid)試薬での解析　 32.5～39 Gb  ※いずれも最大で2億6000万リード
しかしながら、illuminaシーケンサーの解析原理であるSBS（Sequencing By Synthesis）法では解析する配列によって得られるデータ量が変化します。 一般的にはアンプリコン（PCR産物)についてはデータ量が少なくなる傾向にあります。 また、解析時には必ずコントロールとして PhiX ライブラリーをサンプルに応じて10～30 % 程度添加します。 このような理由から、弊社はデータ量の保証は行っておりません。

【データ解析】

データ解析作業の一例は以下の通りです。 その他、パッケージサービスで選択可能な解析オプションもご指定いただけます。外部取得データ（お手持ちのfastqファイル）を使用したデータ解析にもご利用可能ですので、詳しくはお問い合わせください。
作業内容 価格
アセンブルとコンティグ作成 40,000円/サンプル
QIIME等でのデータ解析 1,000円/サンプル
【サンプルおよびデータの保管期限】
サンプルおよびデータの保管期限は、パッケージサービスと同様です。

DNAシーケンス解析

次世代シーケンス解析

フラグメント解析