TOP >  フラグメント解析　サービスと価格

フラグメント解析　サービスと価格

サービス内容

お客様が蛍光プライマーを用いて増幅したPCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動でフラグメント長を判定します。

価格及び納期

弊社ではサンプル数に応じて2種類の価格設定をご用意しております。
【お知らせ】
※午後に到着したサンプルにつきましては、納期を1営業日加算させていただきます。

 

スタンダードプラン(※8連チューブにてサンプルをご送付下さい)

価格 ￥500/サンプル　※8サンプル以下は一律￥4,000となります。
納期 サイジングデータあり：3営業日以内 サイジングデータなし：2営業日以内

プレートプラン
(※プレートにてサンプルをお送り下さい。68サンプル以上の場合、プレートプランでご依頼下さい)

価格 ￥33,600/枚(96サンプル)
納期 サイジングデータあり：3営業日以内

 

(2プレートまで)

 サイジングデータなし：2営業日以内

 

(2プレートまで)
※2プレートごとに納期を加算させていただきます。
※別日にご依頼いただいた場合で、さらに前回ご依頼いただいた分の出荷が済んでいない場合には、前回ご依頼いただいた分の最終出荷日を到着日として換算させていただきますので、予めご了承ください。

ご提供いただくもの

  • (1)PCR増幅産物(10µl)　※予め蛍光標識されたものからの受け入れとなります。
  • (2)電気泳動写真　※併せて電気泳動へのサンプル及びマーカーの供与量をご記入ください。
  • 　 　　　　　　　　 またマーカーから算出される各PCR産物濃度も概算で構いませんのでご記入ください。
  • 【重要】
  • スタンダード8連プランの際は8連チューブに、プレートプランの場合はプレートにてサンプルをご送付
  • ください。(空きウェルは切ったりせずに、何も入れない空の状態でお送りください)

解析の流れ

  • (1)お客様よりサンプル送付
  • (2)サンプル到着後、お客様へサンプル受領のご連絡を行います。
  • (3)サンプル濃度に基づき、サンプルの希釈を実施いたします。
  • (4)サイズスタンダード、ホルムアミドを添加し、シーケンサーによる泳動を行います。
  • (5)得られたデータを解析ソフトにインポートし、データチェックならびにサイジングデータを作成します。
  • (6)お客様へデータを納品いたします。
[納品物]クロマトデータ(.fsaファイル)、サイジングデータ(.xlsファイル、オプションによる)

※

サンプルは、冷凍便、冷蔵便、保冷剤同封の普通便、いずれかでお送りください。
なお、サンプルの発送は着払いにて承ります。

※

サンプルをプールした場合は1サンプルとして対応させていただきます。
(例)2サンプルをプール⇒1サンプル

解析条件

  • 使用キャピラリーシーケンサー：3730xl DNA Analyzer
  • 使用キャピラリー長/ポリマー：50cm/POP7
データの確認はフラグメント解析専用のソフトウェア「Peak Scanner2」をご利用ください。
※Thermofisher SCIENTIFIC社のHPより、下記のURLにてフリーでダウンロードできます。

Dye setフィルター

弊社では以下のフィルターセットをご用意しており、1オーダーにつき適した1フィルターを選択し、解析を行います。 以下の対応する蛍光標識をご確認いただき、使用する蛍光標識、サンプルをプールする場合の標識の組み合わせにご注意ください。 なお、以下の蛍光標識、Dyesetフィルター以外にも対応可能な場合がございますので、お気軽にご相談ください。

G5

    • FAM
    • VIC
    • NED
    • PET対応/サイズスタンダード：500LIZ、600LIZ、1200LIZ(※2)

    J6

      • FAM
      • VIC
      • NED
      • SID
      • TAZ対応/サイズスタンダード：500LIZ、600LIZ、1200LIZ(※2)
      ※2 1200LIZ使用は追加料金がかかりますので、予めご了承ください。
      スタンダードプランの場合 ＋￥200/サンプル
      プレートプランの場合 ＋￥5,000/枚

D

  • FAM
  • HEX
  • NED対応/サイズスタンダード：400ROX、500ROX

F

  • FAM
  • JOE
  • NED対応/サイズスタンダード：400ROX、500ROX

E5(SNaPshotサンプル泳動用)

  • dR110
  • dR6G
  • dTAMRA
  • dROX対応/サイズスタンダード：120LIZ

 


※SNaPshotサンプルを弊社の機器条件で泳動する場合、20bp付近のピークが30bp付近までずれ込む現象を、
複数のユーザー様よりご報告いただいております。
シングルプレックスの泳動の場合問題ございませんが、マルチプレックスの場合、アリル判定が困難になるためご注意ください。

プロメガ社キット泳動用(PowerPlexシリーズ/MSI anlysisなど)

  • 4C(Fluorescein
  • JOE
  • TMR)対応/サイズスタンダード：ILS600

 

  • 5C(Fluorescein
  • JOE
  • TMR-ET
  • CXR-ET)対応/サイズスタンダード：ILS500

 

※使用をご希望の際はご相談ください。

 

カスタムサービス

弊社ではDNA抽出、PCR作業などウェットな作業や、マイクロサテライト解析のジェノタイピング(多型判定)の実績もございます。上記サービス以外のご要望がございましたら、ご相談いただければ幸いです。

DNAシーケンス解析

次世代シーケンス解析

フラグメント解析