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ＰＮＡ（ペプチド核酸）について
PNAはDNA類似の構造をもつ非天然の化合物です。（下図参照）
その構造はDNAやRNAとは異なり、リン酸結合ではなくペプチド結合で骨格を形成している事よりペプチド核酸 と呼ばれています。
PNAはアンチセンスやプローブとして優れた特性を有します。従来のDNAに見られたリン酸基による 負電荷の反発がＰＮＡでは解消されているために、より強くハイブリダイズし、相補鎖認識力も向上しています。
特に
- １）短時間で高感度に目的の核酸を検出できる。
- ２）配列中の1塩基置換を容易に検出可能な物質として注目されています。
そのためアンチセンス医薬品、臨床診断薬あるいは分子生物学研究用試薬などの様々な応用研究への利用が期待されています。
これまでのDNAでは検出できなかったものがPNAでは検出可能です。
最近の論文ではその優れた効果が多数報告されています。ぜひ一度ご検討ください。
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技術情報を更新しました
ＰＮＡの構造
ＰＮＡの特徴
（１）相補的配列を有するDNAおよびRNA鎖に塩基配列特異的に強く結合します。
| Duplex | Tm値 |
|---|---|
| PNA/DNA | 69℃ |
| DNA/DNA | 54℃ |
| PNA/RNA | 72℃ |
| DNA/RNA | 50℃ |
PNAはDNA/RNAよりもTm値が高い事より、その結合の強さが分かります。 そのため短時間で高感度に目的の核酸を検出できます。DNAプローブで検出できなかったものでも PNAではその検出が期待できます。
（２）低いイオン強度においても強くハイブリダイズが可能。
| 塩濃度 | PNA/DNA | DNA/DNA |
|---|---|---|
| 0mM | 72℃ | 38℃ |
| 140mM | 69℃ | 56℃ |
| 1000mM | 65℃ | 65℃ |
低塩濃度の状態でも相補鎖に強くハイブリダイズし、取り扱いが容易です。
DNAのようなhybridizationの条件を検討する作業が簡単にできハイブリダイズの時間短縮が可能です。
（３）塩基配列の選択性が高い。
| Duplex | Tmの減少量 |
|---|---|
| PNA/DNA | 8～21℃ |
| DNA/DNA | 4～16℃ |
Tm値の差が大きい事よりDNAよりも塩基配列選択性が高い事が分かります。そのため1塩基置換が検出可能です。
PCR clamping法を用いて１塩基置換検出を容易に検出した例が報告されています。
（４）ヌクレアーゼやプロテアーゼに対して耐性があります。
核酸とペプチドの構造を合わせ持つために消化酵素に耐性があります。
そのため取り扱いが非常に容易です。
また、細胞内での分解も防げ、アンチセンスとして効果が期待できます。
ＰＮＡの主な用途
- ●Antisense/Antigene
- ●Detection of rare mutants
- ●Arrays
- ●PCR clamping
- ●FISH or In situ hybridization probe
- ●Southern/northern and Pregel hybridization probe
その他、様々な用途でＰＮＡは用いられています。
■Peter E. Nielsen, Michael Egholm (1999). An Introduction to Peptide Nucleic Acid. Current Issues Molec. Biol. 1(2): 89-104.
■ Franck Pellestor, Petra Paulasova (2004). The peptide nucleic acids (PNAs), powerful tools for molecular genetics and cytogenetics. Eur. J. Hum. Genet. 12: 694‒700.
■Munira F. Fouz, Daniel H. Appella (2020). PNA Clamping in Nucleic Acid Amplification Protocols to Detect Single Nucleotide Mutations Related to Cancer. Molecules. 25(4): 786
■Takuya Araki et al.(2010). Usefulness of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Clamp Smart Amplification Process Version 2 (SmartAmp2) for Clinical Diagnosis of KRAS Codon12 Mutations in Lung Adenocarcinoma.J Mol Diagn. 12:118-124.
■ Franck Pellestor, Petra Paulasova (2004). The peptide nucleic acids (PNAs), powerful tools for molecular genetics and cytogenetics. Eur. J. Hum. Genet. 12: 694‒700.
■Munira F. Fouz, Daniel H. Appella (2020). PNA Clamping in Nucleic Acid Amplification Protocols to Detect Single Nucleotide Mutations Related to Cancer. Molecules. 25(4): 786
■Takuya Araki et al.(2010). Usefulness of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Clamp Smart Amplification Process Version 2 (SmartAmp2) for Clinical Diagnosis of KRAS Codon12 Mutations in Lung Adenocarcinoma.J Mol Diagn. 12:118-124.
配列に関するガイドライン
ＰＮＡは合成できる配列に以下のような制限があります。
＜鎖長＞
合成できる長さは18mer以内です。
ただしリンカー、各種ラベルは塩基数にカウントしません。
19塩基以上をご希望の際はお問い合わせください。
＜プリン（ＡとＧ）含量＞
プリンリッチな配列はアグリゲーションを起こしたり、溶解性が低い場合がありますので次の事項にしたがってください。
- （１）１０塩基中プリン塩基が８個以上含んではいけない。
- （２）プリン塩基が６個以上連続してはいけない。
- （３）特にＧは５個以上連続してはいけない
- （４）自己相補的な配列はなるべく避ける
- ■上記の配列が避けられない場合は、相補鎖を検討してください。
- ■それでも不可能な時は別の配列を検討してください。
- ■上記の制限にあたる配列をご希望の際は一度お問い合わせください
サービス概要
精製方法/純度
精製方法は、HPLC精製のみです。
純度90％以上
収量
未修飾品：50nmole
修飾品：25nmole
※ご依頼内容によりましては上記と異なる場合がございます。
※上記以上の収量をご希望の場合は、お見積りご依頼時にご指定ください。
標識
アミノ酸、ペプチド、Biotin、各種蛍光色素標識の付加も可能です。
まずはお気軽にお問合せ・お見積り依頼をお願いいたします。
そのほか
以下につきましても対応可能です。
- ■細胞透過性ペプチド
- ■PNA FISH用ストックプローブ
- ■Gamma PNA
まずはお気軽にお問合せ・お見積り依頼をお願いいたします。
技術情報
PNAに関わる技術資料/アプリケーションノートはこちらからご確認できます。