DNA多型解析
ジェノタイピング(遺伝子型判定)サービス
電気泳動により得られたマイクロサテライトやAFLPデータについて、 GeneMapper Softwareを用いたジェノタイピング(遺伝子型判定)を行います。
結果は、各アリルのサイズ値をエクセルデータにまとめてご報告致します。
【価格】
マイクロサテライト | 1プレート(96サンプル) | 2プレート(96サンプル) | 3プレート(96サンプル) |
---|---|---|---|
1マーカー | ¥10,000 | ¥18,000 | ¥26,000 |
2マーカー | ¥15,000 | ¥23,000 | ¥31,000 |
3マーカー | ¥20,000 | ¥28,000 | ¥36,000 |
4マーカー | ¥25,000 | ¥33,000 | ¥41,000 |
サンプル数は、1プレート(96サンプル)単位での受付とさせて頂きます。
1プレート以下での解析をご希望の際は、ご相談下さい。
【納期】
1週間程度でのご報告
(電気泳動の納期は別途加算となります)
【納品物】
alleleデータ(.xlsx)
【ご依頼方法について】
Webサイトよりフラグメント解析をご依頼の際に、注文画面下方にあります[その他ご要望事項:]に「マイクロサテライトジェノタイピング希望」とご記入ください。
(オーダーシートにてご依頼の際は、メールに添付いただく際のメール本文にご記入ください。)
ご依頼後に、弊社からマーカー詳細情報(マーカーのおよそのサイズ値や繰り返し数等)を記入いただくエクセルフォーマットをメールにて送付いたしますので、内容をご記入後、下記のアドレスまで送付ください。
<エクセルフォーマット送付先>
【統計分析サービス】
ジェノタイピング後の多型データを用いて、
下記のような簡単な統計分析をお受けいたします。
見積もりベースでご案内しますので、ご要望あればご連絡ください。
(シーケンスデータやSNPデータの解析につきましても、ご要望あればご連絡下さい)
【解析事例】
- 主成分分析/主成分判別分析
- ハーディー・ワインベルグ検定
- F統計量(FstやFis/その他Gst Rst統計量等)
- 系統樹作成
- ハプロタイプネットワーク
- 連鎖不平衡解析 等
<データ例>
3集団のモグラの、10locusによるマイクロサテライト多型解析
(左が主成分分析・右が主成分分析の判別分析)

【解析の流れ】
① シーケンサーによる泳動
マルチプレックスPCRまたはPCR後にサンプルをプールすることで、1ウェルあたり複数のマーカーを泳動できます。

② Gene Mapperによるジェノタイピング
送付いただいたマーカー詳細情報に基づき、GeneMapper独自のアルゴリズムにより、マーカーごとにジェノタイピングを実施します。

③ データのご報告
alleleデータ(二つのアリルのピークサイズ値) を、エクセルデータにてご報告します。

④ 統計分析
ご要望あれば、上記ご案内しました統計分析も併せて実施します。