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DNA多型解析

ジェノタイピング(遺伝子型判定)サービス

電気泳動により得られたマイクロサテライトデータについて、 GeneMapper Softwareを用いたジェノタイピング(遺伝子型判定)を行います。
結果は、各アリルのサイズ値をエクセルデータにまとめてご報告致します。
(注1)二倍体生物種のみを対象としております。
(注2)多数のスタッターピークやその他アーティファクトによりタイピングが困難であると判断した場合、キャンセルさせていただく場合がございます。

【価格】

マイクロサテライト 1プレート(96サンプル)
1マーカー ¥10,000
2マーカー ¥15,000
3マーカー ¥20,000
4マーカー ¥25,000
サンプル数は、1プレート(96サンプル)単位での受付とさせて頂きます。

【納期】

1週間程度でのご報告
(電気泳動の納期は別途加算となります)

【納品物】

alleleデータ(.xlsx)

【ご依頼方法について】

Webサイトよりフラグメント解析をご依頼の際に、注文画面下方にあります[その他ご要望事項：]に「マイクロサテライトジェノタイピング希望」とご記入ください。
(オーダーシートにてご依頼の際は、メールに添付いただく際のメール本文にご記入ください。)
ご依頼後に、弊社からマーカー詳細情報(マーカーのおよそのサイズ値や繰り返し数等)を記入いただくエクセルフォーマットをメールにて送付いたしますので、内容をご記入後、下記のアドレスまで送付ください。
＜エクセルフォーマット送付先＞

【統計分析サービス】

ジェノタイピング後の多型データを用いて、
下記のような簡単な統計分析をお受けいたします。
見積もりベースでご案内しますので、ご要望あればご連絡ください。
(シーケンスデータやSNPデータの解析につきましても、ご要望あればご連絡下さい)

【解析事例】

  • 主成分分析
  • ハーディー・ワインベルグ検定
  • F統計量(FstやFis/その他Gst Rst統計量等)
  • 系統樹作成
  • 連鎖不平衡解析　等
＜データ例＞
3集団のモグラの、10locusによるマイクロサテライト多型解析
(左が主成分分析・右が主成分分析の判別分析)

【解析の流れ】

① シーケンサーによる泳動
マルチプレックスPCRまたはPCR後にサンプルをプールすることで、1ウェルあたり複数のマーカーを泳動できます。
② Gene Mapperによるジェノタイピング
送付いただいたマーカー詳細情報に基づき、GeneMapper独自のアルゴリズムにより、マーカーごとにジェノタイピングを実施します。
③ データのご報告
alleleデータ(二つのアリルのピークサイズ値) を、エクセルデータにてご報告します。
④ 統計分析
ご要望あれば、上記ご案内しました統計分析も併せて実施します。

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