SSRマーカー開発サービス / SSRジェノタイピングサービス
SSRマーカー開発サービス
調査対象の生物種を1個体送付いただきます。Miseqを用いてゲノム中からSSRマーカー領域を探索し、候補リスト(.xlsx)にて納品いたします。
データベースからのSSRマーカーの探索のみのご依頼も可能です。
ご興味ございましたら、下記の宛先までお問い合わせください。
〒243-0021
神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービルA棟4階
株式会社ファスマック シーケンスサービス
TEL:046-281-9902 FAX:046-281-9931
ジェノタイピング(遺伝子型判定)サービス
電気泳動により得られたマイクロサテライトデータについて、 GeneMapper Softwareを用いたジェノタイピング(遺伝子型判定)を行います。
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結果は、各アリルのサイズ値をエクセルデータにまとめてご報告致します。
(注1)二倍体生物種のみを対象としております。
(注2)多数のスタッターピークやその他アーティファクトによりタイピングが困難であると判断した場合、キャンセルさせていただく場合がございます。
(注1)二倍体生物種のみを対象としております。
(注2)多数のスタッターピークやその他アーティファクトによりタイピングが困難であると判断した場合、キャンセルさせていただく場合がございます。
【価格】
マイクロサテライト | 1プレート(96サンプル) |
---|---|
1マーカー | ¥10,000 |
2マーカー | ¥15,000 |
3マーカー | ¥20,000 |
4マーカー | ¥25,000 |
サンプル数は、1プレート(96サンプル)単位での受付とさせて頂きます。
【納期】
1週間程度でのご報告
(電気泳動の納期は別途加算となります)
【納品物】
alleleデータ(.xlsx)
【ご依頼方法について】
Webサイトよりフラグメント解析をご依頼の際に、注文画面下方にあります[その他ご要望事項:]に「マイクロサテライトジェノタイピング希望」とご記入ください。
(オーダーシートにてご依頼の際は、メールに添付いただく際のメール本文にご記入ください。)
ご依頼後に、弊社からマーカー詳細情報(マーカーのおよそのサイズ値や繰り返し数等)を記入いただくエクセルフォーマットをメールにて送付いたしますので、内容をご記入後、下記のアドレスまで送付ください。
<エクセルフォーマット送付先>
【解析の流れ】
① シーケンサーによる泳動
マルチプレックスPCRまたはPCR後にサンプルをプールすることで、1ウェルあたり複数のマーカーを泳動できます。
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② Gene Mapperによるジェノタイピング
送付いただいたマーカー詳細情報に基づき、GeneMapper独自のアルゴリズムにより、マーカーごとにジェノタイピングを実施します。
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③ データのご報告
alleleデータ(二つのアリルのピークサイズ値) を、エクセルデータにてご報告します。
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④ 統計分析
ご要望あれば、上記ご案内しました統計分析も併せて実施します。