SSRマーカー開発サービス / SSRジェノタイピングサービス

SSRマーカー開発サービス

調査対象の生物種を1個体送付いただきます。Miseqを用いてゲノム中からSSRマーカー領域を探索し、候補リスト(.xlsx)にて納品いたします。
データベースからのSSRマーカーの探索のみのご依頼も可能です。
ご興味ございましたら、下記の宛先までお問い合わせください。
〒243-0021
神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービルA棟4階
株式会社ファスマック シーケンスサービス
TEL:046-281-9902 FAX:046-281-9931

ジェノタイピング(遺伝子型判定)サービス

電気泳動により得られたマイクロサテライトデータについて、 GeneMapper Softwareを用いたジェノタイピング(遺伝子型判定)を行います。
結果は、各アリルのサイズ値をエクセルデータにまとめてご報告致します。
(注1)二倍体生物種のみを対象としております。
(注2)多数のスタッターピークやその他アーティファクトによりタイピングが困難であると判断した場合、キャンセルさせていただく場合がございます。

【価格】

マイクロサテライト 1プレート(96サンプル)
1マーカー ¥10,000
2マーカー ¥15,000
3マーカー ¥20,000
4マーカー ¥25,000
サンプル数は、1プレート(96サンプル)単位での受付とさせて頂きます。

【納期】

1週間程度でのご報告
(電気泳動の納期は別途加算となります)

【納品物】

alleleデータ(.xlsx)

【ご依頼方法について】

Webサイトよりフラグメント解析をご依頼の際に、注文画面下方にあります[その他ご要望事項:]に「マイクロサテライトジェノタイピング希望」とご記入ください。
(オーダーシートにてご依頼の際は、メールに添付いただく際のメール本文にご記入ください。)
ご依頼後に、弊社からマーカー詳細情報(マーカーのおよそのサイズ値や繰り返し数等)を記入いただくエクセルフォーマットをメールにて送付いたしますので、内容をご記入後、下記のアドレスまで送付ください。
<エクセルフォーマット送付先>

【解析の流れ】

① シーケンサーによる泳動
マルチプレックスPCRまたはPCR後にサンプルをプールすることで、1ウェルあたり複数のマーカーを泳動できます。
② Gene Mapperによるジェノタイピング
送付いただいたマーカー詳細情報に基づき、GeneMapper独自のアルゴリズムにより、マーカーごとにジェノタイピングを実施します。
③ データのご報告
alleleデータ(二つのアリルのピークサイズ値) を、エクセルデータにてご報告します。
④ 統計分析
ご要望あれば、上記ご案内しました統計分析も併せて実施します。

DNAシーケンス解析

次世代シーケンス解析

フラグメント解析