DNAシーケンス解析 解析の流れ

解析の流れ

工程の詳細と、データ不良時の確認・再解析の流れを示します。

1. STEP 1

   サンプル調製

   電気泳動チェックによりテンプレートDNAの純度・濃度を確認し、 シーケンス反応に使用するDNA量を決定します。

   Premix、レンタル、セミレンタルではお客様が実施
2. STEP 2

   シーケンス反応

   BigDye Terminator v3.1を使用してシーケンス反応を行います。

   レンタル、セミレンタルではお客様が実施
3. STEP 3

   シーケンス反応産物の精製

   BigDye XTerminatorを使用して反応産物を精製します。

   レンタルではお客様が実施
4. STEP 4

   シーケンサーによる泳動（ラン）

   3730xl DNA Analyzerを使用して泳動します。

   Premix2、レンタル、セミレンタル：1hr（提供base数 800 base）
   その他の解析サービス：2hr（提供base数 1000 base）

5. STEP 5

   データQuality Check

   全データを専門スタッフが確認します。

   データ不良の場合

   条件を変更して再泳動し、STEP4へ戻ります。

   例：シーケンサーのインジェクション効率の調整、サンプル濃度の希釈など

6. STEP 6

   再反応

   再泳動で改善されない場合は、シーケンス反応条件を変更して再反応を行い、 STEP2へ戻ります。

   Premix1、ワンパス、ノーマルのみの実施

   例：GC-richが疑われる場合に、高次構造に特化した試薬を使用するなど

7. STEP 7

   データアセンブル

   マニュアルによるcontigデータ作成、比較データ作成、Primer walkingなどを行います。

   対応範囲はご依頼コースにより異なります。

コース別の実施工程・納品物

詳細な対応範囲は比較表で確認できます。なお、解析オプションの追加により、対応可能な範囲が広がる場合があります。

納品データ