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DNA定量解析

ゲノムDNAを送付いただき、サンプルに含まれるDNA量を、LightCycler ® 96 SystemによるリアルタイムPCRにて定量いたします。
TaqManプローブ法、インターカレーター法のいずれかの方法をお選び下さい。
(RNAサンプルの相対定量につきましては、現在お受けしておりせん。あらかじめご了承下さい)
プライマー/プローブの設計・合成や、ゲノムDNAの抽出からもご依頼可能です。
プライマー/プローブの設計につきましては、基本的にはTaqManプローブ法による設計となります。インターカレーター法による設計をご希望の場合は、PCR条件の最適化のために少しお時間がかかります。一度お問い合わせください。

＜解析例＞

  • 環境水からの生物種特異的な定量(環境DNA※)
  • 試料中の特定細菌種の定量
  • 試料中の特定核酸の定量　etc.
※環境DNAの種特異的な定量は、環境省のHPから下記の論文(プライマーリスト)が公表されています。ご参考ください。

価格・納期

価格・納期(8サンプル・1領域あたり)
価格 ￥60,000
納期 7営業日
オプション 価格 納期
プライマー/
プローブ設計・合成※1
 お客様より解析対象の生物情報をご連絡いただき、弊社にてin silicoにて設計するか、論文検索いたします +￥60,000/領域※3 +8営業日
プライマー/
プローブ合成※2
 お客様よりプライマー・プローブの配列情報を開示いただき、弊社にて合成から承ります +￥20,000/領域※3 +4営業日
DNA抽出 GenCheck® DNA Extraction Reagentシリーズや、その他kitにて実施します +￥20,000/8検体 +5営業日
環境水からの受け入れ 環境DNA解析用として、水サンプルから抽出を実施します +￥1,000/サンプル ー
※1　in silicoにより弊社で設計する場合、生物種によっては設計できずお受けできない可能性がございます。
※2TaqManプローブ法の価格となります。また、蛍光色素はFAM、クエンチャーはBHQ-1になります。
インターカレーター法(プライマー合成から)の場合、無料にてプライマー合成いたします。
※3FAM以外の色素(HEX等の)をご希望の場合、+￥10,000追加料金とさせていただきます。

お送りいただくもの

  • ゲノムDNAまたは抽出前組織※4
  • プライマーおよびプローブ※5(それぞれ濃度10µMで10µl[8サンプルの場合])
※4抽出前組織の場合、弊社にてDNA抽出から実施します。
※5プライマー/プローブ合成オプションまたは設計オプションを選択頂いた場合、弊社にて合成する為、送付は不要です。

解析条件

Thermal cycler：LightCycler ® 96 System(Roche)
[ 対応蛍光色素 ]
(TaqManプローブ法)　FAM、HEX、VIC、Texas Red、Cy5等
(インターカレーター法)　SYBR Green

PCRについて

  • PCRは1サンプル当たり3反復実施します。
  • プライマー/プローブをお送りいただく場合、PCR温度条件も併せてお知らせください。

納品物

  • Cq値/定量値(コピー数など)をまとめたデータファイル(.xlsx)
  • 報告書(PDF)

見積もり・発注・問い合わせについて

下記のフォームをご利用ください。

サンプルの送付先について

〒243-0021 神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービルA棟4階
株式会社ファスマック　シーケンスサービス
　Tel: 046-281-9902

解析事例

中津川～相模川水系の4地点における環境水から、リアルタイムPCRによる3魚種
(アユ・ヤマメ・メダカ)のeDNA検出の結果
アユのeDNA検出の結果 ヤマメのeDNA検出の結果 メダカのeDNA検出の結果
・使用したプライマー/プローブについては、下記参照
[ アユ ]
Yamanaka H, Minamoto T (2016) The use of environmental DNA of fishes as an efficient method of determining habitat connectivity.
[ メダカ ]
Tsuji S, Iguchi Y, Shibata N, Teramura I, Kitagawa T, Yamanaka H (2018) Real-time multiplex PCR for simultaneous detection of multiple species from environmental
[ ヤマメ ]
自社設計(Primer-BLAST)

＜納品データ例＞

中津川～相模川水系の4地点のアユDNAコピー数の定量結果

ゲノム編集ツール「Genome craft」

ランダムインテグレーション解析「RAISING」

その他応用技術

「応用技術」資料のダウンロード