SSRマーカー開発サービス / SSRジェノタイピングサービス

SSRマーカー開発サービス

調査対象の生物種を1個体送付いただきます。Miseqを用いてゲノム中からSSRマーカー領域を探索し、候補リスト(.xlsx)にて納品いたします。

データベースからのSSRマーカーの探索のみのご依頼も可能です。

ご興味ございましたら、下記の宛先までお問い合わせください。

〒243-0021

神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービルA棟4階

株式会社ファスマックシーケンスサービス

TEL：046-281-9902　FAX:046-281-9931

電気泳動により得られたマイクロサテライトデータについて、 GeneMapper Softwareを用いたジェノタイピング(遺伝子型判定)を行います。

結果は、各アリルのサイズ値をエクセルデータにまとめてご報告致します。
(注1)二倍体生物種のみを対象としております。
(注2)多数のスタッターピークやその他アーティファクトによりタイピングが困難であると判断した場合、キャンセルさせていただく場合がございます。

サンプル数は、1プレート(96サンプル)単位での受付とさせて頂きます。

1週間程度でのご報告

(電気泳動の納期は別途加算となります)

alleleデータ(.xlsx)

Webサイトよりフラグメント解析をご依頼の際に、注文画面下方にあります[その他ご要望事項：]に「マイクロサテライトジェノタイピング希望」とご記入ください。

(オーダーシートにてご依頼の際は、メールに添付いただく際のメール本文にご記入ください。)

ご依頼後に、弊社からマーカー詳細情報(マーカーのおよそのサイズ値や繰り返し数等)を記入いただくエクセルフォーマットをメールにて送付いたしますので、内容をご記入後、下記のアドレスまで送付ください。

＜エクセルフォーマット送付先＞

① シーケンサーによる泳動

マルチプレックスPCRまたはPCR後にサンプルをプールすることで、1ウェルあたり複数のマーカーを泳動できます。

② Gene Mapperによるジェノタイピング

送付いただいたマーカー詳細情報に基づき、GeneMapper独自のアルゴリズムにより、マーカーごとにジェノタイピングを実施します。

③ データのご報告

alleleデータ(二つのアリルのピークサイズ値) を、エクセルデータにてご報告します。

④ 統計分析

ご要望あれば、上記ご案内しました統計分析も併せて実施します。