フラグメント解析 サービスと価格

サービス内容

お客様が蛍光プライマーを用いて増幅したPCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動でフラグメント長を判定します。

価格及び納期

弊社ではサンプル数に応じて2種類の価格設定をご用意しております。
【お知らせ】
※午後に到着したサンプルにつきましては、納期を+1日加算させていただきます。
 

スタンダードプラン(※8連チューブにてサンプルをご送付下さい)

価格 ¥500/サンプル ※8サンプル以下は一律¥4,000となります。
納期 サイジングデータあり:3営業日以内 サイジングデータなし:2営業日以内

プレートプラン(※プレートにてサンプルをご送付下さい)

価格 ¥33,600/枚(96サンプル)
納期 サイジングデータあり:3営業日以内

(2プレートまで)

サイジングデータなし:2営業日以内

(2プレートまで)

ご提供いただくもの

  • (1)PCR増幅産物(10µl) ※予め蛍光標識されたものからの受け入れとなります。
  • (2)電気泳動写真 ※併せて電気泳動へのサンプル及びマーカーの供与量をお知らせください。
  • 【重要】
  • スタンダード8連プランの際は8連チューブに、プレートプランの場合はプレートにてサンプルをご送付
  • ください。(空きウェルは切ったりせずに、何も入れない空の状態でお送りください)

解析の流れ

  • (1)お客様よりサンプル送付
  • (2)サンプル到着後、お客様へサンプル受領のご連絡を行います。
  • (3)サンプル濃度に基づき、サンプルの希釈を実施いたします。
  • (4)サイズスタンダード、ホルムアミドを添加し、シーケンサーによる泳動を行います。
  • (5)得られたデータを解析ソフトにインポートし、データチェックならびにサイジングデータを作成します。
  • (6)お客様へデータを納品いたします。
[納品物]クロマトデータ(.fsaファイル)、サイジングデータ(.xlsファイル、オプションによる)
サンプルは、冷凍便、冷蔵便、保冷剤同封の普通便、いずれかでお送りください。
なお、サンプルの発送は着払いにて承ります。
サンプルをプールした場合は1サンプルとして対応させていただきます。
(例)2サンプルをプール⇒1サンプル

解析条件

  • 使用キャピラリーシーケンサー:3130xl Genetic Analyzer、3730xl DNA Analyzer
  • 使用キャピラリー長/ポリマー:50cm/POP7
  • 解析ソフトウェア:Gene Mapper、Peak Scanner2
データの確認はフラグメント解析専用のソフトウェア「Peak Scanner2」をご利用ください。
※Thermofisher SCIENTIFIC社のHPより、下記のURLにてフリーでダウンロードできます。

Dye setフィルター

弊社では以下のフィルターセットをご用意しており、1オーダーにつき適した1フィルターを選択し、解析を行います。 以下の対応する蛍光標識をご確認いただき、使用する蛍光標識、サンプルをプールする場合の標識の組み合わせにご注意ください。 なお、以下の蛍光標識、Dyesetフィルター以外にも対応可能な場合がございますので、お気軽にご相談ください。

G5

    • FAM
    • VIC
    • NED
    • PET対応/サイズスタンダード:500LIZ、600LIZ、1200LIZ(※)
※(1200LIZ)追加料金がかかりますので、予めご了承ください。
スタンダードプランの場合 +¥200/サンプル ※8サンプル以下は一律¥5,600となります。
プレートプランの場合 +¥5,000/枚

D

  • FAM
  • HEX
  • NED対応/サイズスタンダード:400ROX、500ROX

F

  • FAM
  • JOE
  • NED対応/サイズスタンダード:400ROX、500ROX

E5(SNaPshotサンプル泳動用)

  • dR110
  • dR6G
  • dTAMRA
  • dROX対応/サイズスタンダード:120LIZ

プロメガ社キット泳動用(PowerPlexシリーズ/MSI anlysisなど)

    • 4C(Fluorescein
    • JOE
    • TMR)対応/サイズスタンダード:ILS600
 
  • 5C(Fluorescein
  • JOE
  • TMR-ET
  • CXR-ET)対応/サイズスタンダード:ILS500
 

カスタムサービス

弊社ではDNA抽出、PCR作業などウェットな作業や、マイクロサテライト解析のジェノタイピング(多型判定)の実績もございます。上記サービス以外のご要望がございましたら、ご相談いただければ幸いです。