フラグメント解析 サービスと価格

サービス内容

お客様が蛍光プライマーを用いて増幅したPCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動でフラグメント長を判定します。

料金

弊社ではサンプル数に応じて2種類のプランをご用意しております。

スタンダードプラン

料金 ¥500/サンプル ※8サンプル以下は一律¥4,000となります。
納期 3営業日以内
電気泳動オプション +¥200/サンプル

プレートプラン

料金 ¥33,600/枚(96サンプル)
納期 5営業日以内
電気泳動オプション +¥2,000/枚
※ランダムに12サンプルをピックアップし、実施します。

ご提供いただくもの

  • (1)PCR増幅産物(10ng/µl以上、10µl以上) ※予め蛍光標識されたものからの受け入れとなります。
  • (2)電気泳動写真 ※併せて電気泳動へのサンプル及びマーカーの供与量をお知らせください。

解析の流れ

  • (1)お客様よりサンプル送付
  • (2)サンプル到着後、お客様へサンプル受領のご連絡を行います。
  • (3)サンプル濃度に基づき、サンプルの希釈を実施いたします。
  • (4)サイズスタンダード、ホルムアミドを添加し、シーケンサーによる泳動を行います。
  • (5)得られたデータを解析ソフトにインポートし、サイジングを行います。
  • (6)お客様へデータを納品いたします。
[納品物]クロマトデータ(.fsaファイル)、サイジングデータ(.xlsファイル)
サンプルは、冷凍便、冷蔵便、保冷剤同封の普通便、いずれかでお送りください。
なお、サンプルの発送は着払いにて承ります。
サンプルをプールした場合は1サンプルとして対応させていただきます。
(例)2サンプルをプール⇒1サンプル
解析ソフトをお持ちでない場合には、フリーソフトをご紹介しておりますので、お気軽にお申し付けください。

解析条件

  • 使用キャピラリーシーケンサー:3130xl Genetic Analyzer、3730xl DNA Analyzer
  • 使用キャピラリー/ポリマー:FA50(50cmキャピラリー)/POP7
  • 解析ソフトウェア:Gene Mapper、peak scanner
※フリーソフトもご紹介しておりますので、お気軽にお申し付け下さい。

Dye setフィルター

弊社では以下のフィルターセットをご用意しており、1オーダーにつき適した1フィルターを選択し、解析を行います。 以下の対応する蛍光標識をご確認いただき、使用する蛍光標識、サンプルをプールする場合の標識の組み合わせにご注意ください。 なお、以下の蛍光標識、Dyesetフィルター以外にも対応可能な場合がございますので、お気軽にご相談ください。

G5(DS-33)

  • 6FAM
  • VIC
  • NED
  • PET対応/サイズスタンダード:500LIZ、600LIZ、1200LIZ(※)

D(DS-31)

  • 6FAM
  • VIC
  • NED対応/サイズスタンダード:400ROX、500ROX

D(DS-30)

  • 6FAM
  • HEX
  • NED対応/サイズスタンダード:400ROX、500ROX
※オプションとなりますので、予めご了承ください。
スタンダードプランの場合 +¥200/サンプル
プレートプランの場合 直接お問い合わせください。
 

カスタムサービス

弊社ではDNA抽出、PCR作業などウェットな作業の実績もございます。上記サービス以外のご要望がございましたら、ご相談いただければ幸いです。